ゲノム編集用ガイドRNA設計ツールCRISPRdirect パッケージ版
・ゲノム編集のガイドRNAの設計に最適！
・GGGenomeパッケージ版同梱！
・デスクトップPC上で高速動作
Windows/Mac/Linuxに対応！
製品概要
ゲノム編集技術CRISPRｰCas9は様々な用途で広く利用されています。CRISPRｰCas9では、ガイドRNAの標的配列への結合とCas9ヌクレアーゼによるDNAの切断が誘導されますが、その際、類似配列の切断と変異導入（オフターゲット作用）が起こります。標的以外の遺伝子への変異は、予測できない悪影響を与える可能性があります。そのため、医薬品開発等では、オフターゲット作用が出来るだけ少ないガイドRNAを選別することが重要なステップとなります。
CRISPRdirect は、高速塩基配列検索ツールGGGenome を利用することにより、特異性の高いガイド RNA を簡便に設計できるツールです。多数の実験動植物や作物などのゲノムに対応し、他のデータベースやソフトウェアとも容易に連携できるよう API が提供されています。DBCLSとNBDCが開発した公開版はインターネット上で利用可能です。
このCRISPRdirectパッケージ版は、公開版が備える機能と遺伝子配列データベースに加えて、情報守秘を目的としたオフラインでの利用を可能にしています。ソフトウェア一式をUSBメモリにパッケージ化して提供しているため外部接続は不要で、検索配列の秘匿化が可能です。さらに、独自の遺伝子配列データベースを追加することも可能です。
CRISPRdirect は、高速塩基配列検索ツールGGGenome を利用することにより、特異性の高いガイド RNA を簡便に設計できるツールです。多数の実験動植物や作物などのゲノムに対応し、他のデータベースやソフトウェアとも容易に連携できるよう API が提供されています。DBCLSとNBDCが開発した公開版はインターネット上で利用可能です。
このCRISPRdirectパッケージ版は、公開版が備える機能と遺伝子配列データベースに加えて、情報守秘を目的としたオフラインでの利用を可能にしています。ソフトウェア一式をUSBメモリにパッケージ化して提供しているため外部接続は不要で、検索配列の秘匿化が可能です。さらに、独自の遺伝子配列データベースを追加することも可能です。
特徴
1. 高い特異性を持つガイドRNAの設計と選択
CRISPRdirectは、様々な生物種においてCRISPR-Cas9ベースのゲノム編集用に高い特異性を持つガイドRNA（gRNA）を設計できます。
2. ガイドRNAの潜在的なオフターゲット部位を検索可能
ガイドRNA設計に利用可能なデータベースは350種以上をサポートしています [全データベースリストはこちらのリンクを参照]
3. 独自データベースの追加機能
ご所属先が保有するデータベースを追加してガイドRNA設計に使用できます。
CRISPRdirectは、様々な生物種においてCRISPR-Cas9ベースのゲノム編集用に高い特異性を持つガイドRNA（gRNA）を設計できます。
2. ガイドRNAの潜在的なオフターゲット部位を検索可能
ガイドRNA設計に利用可能なデータベースは350種以上をサポートしています [全データベースリストはこちらのリンクを参照]
3. 独自データベースの追加機能
ご所属先が保有するデータベースを追加してガイドRNA設計に使用できます。
バンドルデータベース一覧
CRISPRdirect 基本パック
同梱ゲノムデータ（9種、12データベース）
・ Human GRCh38/hg38 , hg19
・ House Mouse GRCm38/mm10
・ Crab-eating macaque macFas5 , macFasRKS1912
・ Marmoset WUGSC 3.2/calJac3 , calJacRKC1912
・ Macaca mulatta BCM Mmul_8.0.1/rheMac8
・ Rat RGSC 6.0/rn6
・ Rabbit Broad/oryCun2
・ Porcine SGSC Sscrofa11.1/susScr11
・ Canine Broad CanFam3.1/CanFam3
オプション機能
・ オプションデータベース：DBCLSが公開するweb版GGGenomeで利用可能なデータベースを追加できます。
・ カスタムデータベース：ご所属先で保有する塩基配列データベースを追加できます。
同梱ゲノムデータ（9種、12データベース）
・ Human GRCh38/hg38 , hg19
・ House Mouse GRCm38/mm10
・ Crab-eating macaque macFas5 , macFasRKS1912
・ Marmoset WUGSC 3.2/calJac3 , calJacRKC1912
・ Macaca mulatta BCM Mmul_8.0.1/rheMac8
・ Rat RGSC 6.0/rn6
・ Rabbit Broad/oryCun2
・ Porcine SGSC Sscrofa11.1/susScr11
・ Canine Broad CanFam3.1/CanFam3
オプション機能
・ オプションデータベース：DBCLSが公開するweb版GGGenomeで利用可能なデータベースを追加できます。
・ カスタムデータベース：ご所属先で保有する塩基配列データベースを追加できます。
動作環境
✓ Windows 10 Pro もしくは Windows 10 Enterprise, Windows 10 Educationの64bit版
✓ Docker Desktop(2.2.0.5での動作を確認しております)
✓ Hyper-Vの有効化(VMWareなどの仮想化ソフトと排他になる可能性があります)
✓ メモリ: 16GB以上(Docker for Windowsに最低8GB以上割り当てる必要があります)
✓ Docker Desktop(2.2.0.5での動作を確認しております)
✓ Hyper-Vの有効化(VMWareなどの仮想化ソフトと排他になる可能性があります)
✓ メモリ: 16GB以上(Docker for Windowsに最低8GB以上割り当てる必要があります)
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